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復旦大學現有35個直屬學院（部）、18所附屬醫院（其中4所正在籌建）。學校有79個本科專業，37個一級學科博士學位授權點，43個一級學科碩士學位授權點（含一級學科博士學位授權點），4個博士專業學位授權點，32個碩士專業學位授權點，35個博士后科研流動站。現有普通本專科生13991人，研究生（含大陸及港澳臺地區全日制和非全日制學生）22232人，學歷生2946人。全校教學科研人員3139人。 有中國科學院、中國工程院院士51人（含雙聘），文科杰出教授1人，文科資深教授13人，國家杰出青年科學基金獲得者118人，各類國家重大青年人才計劃入選者301人。

復旦大學在QS世界大學排名中位列世界第40名、國內第3名。在學術影響力方面，復旦大學有19個學科進入ESI世界前1%，位列中國大陸高校第2位（并列）。其中，化學、材料科學、臨床醫學、藥理學與毒理學均進入世界前1‰。在QS世界學科排名中大學院校庫_2023年各省的大學院校名單及全國985211高等院校庫，復旦大學有29個學科進入世界前100名，總數位列國內第三位；五大學科全部進入世界前100名，中國大陸僅有2所高校躋身其中。在USNews世界學科排名中，復旦大學4個學科進入世界前50名，在泰晤士高等教育世界學科排名中，1個主要學科進入世界前50名。 在第四輪全國一級學科評估中，5個學科被評為A+學科大學院校庫_2023年各省的大學院校名單及全國985211高等院校庫，60%以上的參評學科被評為A級學科，另有14個學科入選上海市高峰學科建設。

學校有國家重點實驗室5個、國家數學中心1個、國家教材建設重點研究基地1個、國家臨床醫學研究中心2個、國家制造業創新中心1個、教育部工程研究中心7個、教育部重點實驗室14個、國家衛生健康委員會重點實驗室9個、總后保障部衛生部重點實驗室1個、上海市重點實驗室15個、上海市工程研究中心11個；有教育部人文社科重點研究基地10個，中國研究院入選首批國家高端智庫建設試點單位，馬克思主義學院入選首批全國重點馬克思主義學院，“中國高校智庫論壇”秘書處落戶復旦。

近年來，復旦大學與世界40多個國家和地區的270多所大學和機構簽訂了合作協議，每年約8000名師生出國留學，每年接待海外來訪人員約5000人次，每年舉辦約100次國際會議。

學校現有邯鄲、楓林、張江、江灣四個校區，總占地面積約243.92萬平方米，校舍建筑面積224.11萬平方米。（數據截止日期2020年4月）